Le Journal de microbiologie environnementale suit le processus d'évaluation par les pairs en double aveugle, les évaluateurs ignorent l'identité des auteurs, et les auteurs ignorent également l'identité des évaluateurs. Il y a au moins un évaluateur externe pour chaque article du numéro afin de valider le travail des chercheurs/universitaires/scientifiques. Le processus de révision de la revue est effectué par les membres du comité de rédaction de la revue, ainsi que par la révision préliminaire du bureau de rédaction.
Chaque manuscrit soumis a été soumis à un contrôle de qualité préliminaire par le bureau éditorial, suivi d'un processus d'examen par les pairs externe. Habituellement, le contrôle qualité préliminaire s'effectue dans un délai de 7 jours et porte principalement sur le formatage de la revue, l'anglais et la portée de la revue.
